يهدف المركز إلى تحقيق الأهداف الآتية:

1- المساهمة في إعداد البحوث والدراسات في مجال تاريخ حضرموت وتجلياته السياسية والاقتصادية والاجتماعية والثقافية.

2- الإسهام في التنمية الثقافية والإعلامية والاجتماعية والاقتصادية والقانونية للمجتمع المحلي  .

3- الإسهام في دراسات تعزيز علاقات التعاون بين الشعوب ذات العلاقة بحضرموت والتي ارتبطت معها بعلاقات تاريخية واقتصادية واجتماعية.

4- المشاركة في تفعيل المجتمع عبر أنشطة تنموية مجتمعية تسهم في تعزيز التنمية الشاملة للمجتمع .

5- إنشاء حاضنة للمبادرات الاجتماعية بتشجيع منظمات مجتمع مدني فعالة وبشكل خاص في مجال مشاريع التنمية وحقوق الإنسان وقضايا البيئة .

6-زيادة فاعلية الكوادر في المؤسسات الحكومية والخاصة من خلال تنفيذ برامج تدريبية خاصة .